1) Их не надо скреплять - теперь можно выбирать несколько слоев и одновременно их трансформирвать.
Но если очень хочется залинковать - внизу палитры Layers есть та самая кнопка: линкуются все выбранные слои.
Но вместо этого архаизма пользуйтесь сетами.
2) Поэтому чтобы загрузить прозрачность со слоя теперь нужно контрл-щелкать не где угодно, а точно по его иконке.
Контрл-щелчок по названию слоя теперь используется для добавления слоя в выделенный диапазон слоев.
