Элементарно Ватсон.
Скролл надо изменит в той странице которую в фрейм загружаешь
Код:
<style type="text/css"> body {scrollbar-arrow-color:#200000; scrollbar-highlight-color:#200000; scrollbar-base-color:#200000; scrollbar-shadow-color:#200000; scrollbar-darkshadow-color:#200000; scrollbar-track-color:#200000</style>
и енто пихать до <head>

вроде так, еси я усё понял правильно!