Во-первых уточните в каком виде хранится в самой базе. И обратите на поле Сравнение в описание полей и таблиц в phpMyAdmin ... по умолчанию часто там стоит greek_general_ci. Чтобы не было проблем при экспорте, надо чтобы там стояло либо cp2151_general_ci, либо koi8r_general_ci.