GIF сохраняется одним слоем, этот формат не поддерживает многослойность (не считаю анимацию гиф) но поддерживает прозрачность. Кол-во цветов можно выставить и выбрать.
Сохраняем для веб >> там выбираем формат GIF >> там можно выбрать цвета по количеству (2 минимум / 256 максимум) тамже можно в Color Table управлять цветами вручную (не нужные удалять и тд)
