Я обычно всегда экспортирую в 10ю версию иллюстратора файлы, сделанные в CS, т.к. 10-я есть фактически во всех типографиях. Или в EPS 10 .
Проблем с цветом тогда не возникает.
в CS (11 версии) это можно сделать самым обычным способом:
export\формат - Illustrator Legacy (AI) или Illustrator Legacy EPS.
А в последнем CS (12 версии) обычно - сохранить как - и там есть возможность выбрать нужную версию при сохранении.