Не смотрите Вы на этот Warning... Смотрите на финальный результат – "This page is not Valid XHTML 1.1!"...

движек грешит, еще пока не разобрался со всеми тонкостями, сам пихает туда JAva скрипты которые и портят малину.
Никакую там у Вас малину ничего не портит. Все дело в XHTML 1.1. Ну нельзя на сегодняшний день такой !DOCTYPE использовать... Нельзя из-за IE6. Потому что XHTML 1.1 можно скармливать браузеру только в совокупности с content-type "application/xhtml+xml". А от такого content-type IE6 впадает в кому... Поэтому остановите свой выбор либо на XHTML 1.0 Strict, либо на XHTML 1.0 Transitional... И скорее всего будет у Вас все валидно...