Грамотные ответы на вопросы 1 и 4 может дать только типография, в которой будет печататься брошюра.
Вопрос 2: только EPS или, в особо трудных случаях (прозрачности, градиенты) - TIF.
Вопрос 3: File -> Preflight -> Links and Images список картинок и их цветовых моделей.