Понимать тут практически нечего.
Вот в такой последовательности должны совершаться действия работы над проектом, по моему мнению.
1.Программирование движка сайта (CMS)
*a) PHP
*б) AJAX
2.Создание дизайна сайта (МАКЕТ)
*а) Верстка
б) CSS
3.Наложение макета на CMS
